而墨水噴碼機標記效果清晰，但易擦除和更改。一般噴碼機防偽效果有限；工作狀態激光打碼機采用在線式高速無停頓激光標記，生產效率高。既可靜態又可生產線高速流動狀態下工作。

        墨水噴碼機采用在線式，生產無停頓，生產效率 較高。某些噴碼機可能會有墨水堵塞噴頭情況發生，影響生產。在操作安裝上激光打碼機直觀的視窗軟件（Windows），操作顯示界面分辯率高，畫面清晰。使打印信息的建立和編輯方便、快捷，安裝簡潔、輕便的機箱，最小最輕的激光打印頭可直接安裝于生產線，適合任何生產空間。

        墨水噴碼機顯示界面簡單，分辯率低。只能對打印信息進行簡單的編輯處理，安裝上體積有大有小，有些機型還需外接空壓機等外接設備。

        在使用成本上而言激光打碼，初始費用高但是運行成本極低,無須任何消耗品，零運營成本。墨水噴碼機一次性購買成本低，噴碼機消耗大量的專用油墨和溶劑，耗材用量大。另外，更換噴頭及其他附件費用高昂，需專門維修人員，還會無計劃停產，造成間接損失。一臺噴碼機的耗材成本在2萬到4萬元之間。

        數據處理方面，激光打碼機控制主機直接采用工控計算機，具有強大的數據處理能力，可連接所有防偽數據系統，滿足多層次防偽需求。墨水噴碼機采用單片機控制，數據處理能力有限，防偽功能不多。

        環保安全方面激光打碼機非接觸式打碼，無污染，無有害物，可通過耐藥水、耐磨、耐高溫不變試驗。酒類、煙草、食品、飲料、藥品生產中已大量使用。符合GB7247-87； GB10320-88標準，墨水噴碼機墨水及溶劑是高揮發性物質，會產生較多的化學有毒殘留物，污染環境。另外，墨水及溶劑的化學成份及氣味完全有可能滲入被打標物體。